É possível deixar configurado para todas as empresas que seja feita a prorrogação do contrato de experiência e a alteração para prazo indeterminado de forma automática.
Para isso deve ativar o setup em Cadastro > Configurações > Configurações gerais > E ativar a configuração Trabalhador - Efetua a prorrogação de contrato e transformação em indeterminado automaticamente no vencimento do prazo

O setup é válido para todas as empresas, e com ele ativado o sistema irá verificar os contratos em experiência (que ainda não foram prorrogados) e efetuar a prorrogação no dia do vencimento, e para aqueles que já foram prorrogados, irá alterar para indeterminado no dia do vencimento no período noturno.
Observação: Caso o funcionário tenha tido afastamento durante o período que suspendeu o contrato, deve ser avaliado se o contrato ficou conforme o desejado, e se necessário ajustar manualmente.